Gelapp: DNA&Prot Gel Analyzer

La 1ère application Android pour analyser les groupes de gels (agarose et page) avec une mise à l'échelle du journal

* Conformément aux modifications du système d'exploitation Android, veuillez accéder aux fichiers locaux à l'aide de Fichier ES Explorer, qui annuisera les cartes Drive / SD. Vous devrez vous rendre dans ES File Explorer pour effectuer d'abord l'enracinement. Veuillez noter que la prise en charge de Dropbox est supprimée en raison des modifications d'Android et de Dropbox.

Il s'agit de la première application Android qui vous permet d'analyser les bandes Gel (Agarose et Page) avec un graphique de journal généré automatiquement à partir des marqueurs. Il permet la détection et le chargement automatique pour les utilisations futures. En utilisant le filtre Gabor, cette application permet aux utilisateurs d'améliorer automatiquement la détection des bandes. Pour les images de mauvaise qualité, les utilisateurs peuvent cliquer peuvent dessiner manuellement une case sur la bande souhaitée ou cliquer sur l'image pour déterminer l'emplacement spécifié.

Les images peuvent être chargées à partir de galerie ou de dropbox, ce qui le rend très pratique. Les meilleures images sont celles générées par des scanners, mais fonctionneront avec des photos bien prises des caméras mobiles.

Les photos doivent être prises sur un plan direct avec le gel.

Les fonctionnalités de cette application comprennent:

1) Spécification de l'agarose ou de la page.

2) Identification des couleurs des bandes de marqueur pour la page.

3) Filtres d'imagerie avancés - Garbor.

4) Traitement d'image automatisé avec entrée utilisateur personnalisée si nécessaire.

5) Enregistrement des paramètres pour le traitement d'image pour une commodité future.

6) Économie des marqueurs pour la commodité future lors de l'utilisation des mêmes marqueurs.

7) Interface utilisateur simple et boutonnée.

8) Détection automatisée des bandes.

9) Boîte à limite définie par l'utilisateur.

10) graphique du journal du marqueur généré automatiquement.

11) Emplacement défini par l'utilisateur de bandes spécifiques.

12) Compatibilité avec le paysage et la vue portrait des tablettes et smartphones de taille multiple.

13) Compatibilité avec les fonctions de capture d'écran des smartphones et tablettes de graphes de gel et de journaux analysés pour les publications ou les rapports.

14) lectures affichées dans l'image du gel avec des boîtes en surbrillance et la taille de la bande calculée.

15) Fonction de recadrage pour les images avant l'analyse.

16) Modifier la fonction pour supprimer les bandes indésirables.

17) Boîtes de couleurs différentes pour les marqueurs et les bandes.

18) Accès direct simple à la galerie d'images pour les images.

19) Compatible avec l'analyse du gel d'agarose SYBR, ETBR.

20) Accès direct à la caméra.

Avantages de l'utilisation de cette application pour les publications

1) apporte une plus grande précision à votre analyse de gel au lieu de s'appuyer sur des approximations.

2) La valeur ajoute aux publications et aux rapports.

3) Outil d'enseignement utile aux étudiants en sciences.

4) Analyse rationalisée, réduisant l'erreur humaine et la subjectivité - vous pouvez maintenant faire confiance aux valeurs rapportées par les stagiaires et le personnel moins expérimenté!

5) Sur l'analyse avec le smartphone / tablette.

6) Analyse automatisée - Pas besoin de papier graphique et de traçage fastidieux.

7) L'application est gratuite!

8) L'application est autonome, aucun accès Internet nécessaire (sauf pour l'analyse Dropbox).

Les utilisateurs d'Android 6 peuvent obtenir des images de la galerie "Image" locale. Les utilisateurs de la version Android antérieurs auront une prise en charge de Dropbox. Cela est dû aux changements dans Android 6 et est hors de notre contrôle.

Pour les instructions à utiliser, veuillez regarder la vidéo sur https://www.youtube.com/watch?v=chlzhy8d_ka&feature=youtu.be

Userguide disponible en PDF sur http://tinyurl.com/gelapp

* Les derniers téléphones, par exemple, Samsung Note 8 peut avoir des problèmes d'économie de caméra. S'il y a de tels problèmes, utilisez la galerie.

Pour citer, veuillez utiliser:

Sim, Jz. *, Nguyen, pv. *, Lee, Hk., Gan, Ske. (2015). GELAPP: analyseur d'électrophorèse sur gel mobile. Nature Méthodes Notes d'application. doi: 10.1038 / an9643

Ou au logiciel direct dans l'App Store

Sim, JZ, Nguyen, PV, GAN, SKE (2014) GELAPP : DNA & PROT GEL Analyzer v1.2. [Mobile Application Software]. Extrait de https://play.google.com

Cette application est un produit du laboratoire de développement des anticorps et des produits, la division de recherche translationnelle, Bioinformatics Institute, Agency for Science, Technology et Research, Singapour.

Les créateurs sont: M. Sim Jia Zhi, M. Nguyen Phi Vu et le Dr Samuel Gan.

(Poly Interne

Quoi de neuf dans la dernière version 1.2.7